生物信息学调研报告3000字

问：如何学好生物信息学？

1. 答：一、计算机基础，需要看三本书，一步步的学会学丛核通，不需要刻意去找哪个书，一般linux是鸟哥私房菜，perl是小骆驼咯，R是R in action，但是看一本书只能入门，真正想成为菜鸟，必须每个要看五本书以上！我云盘里面有这基本上的高清打印版，大家可以去淘宝打印一下才几十块钱还包邮，对书比较讲究的也可以买正版，也不过是一百多块钱而已！二、生信基础知识，测序方面，在百度文库找十几篇一代二代三代测序仪资料仔细研读，然后去优酷下载各大主流测序仪的动画讲解，再看看陈巍学基因的讲解；数据库先看看三大主流数据库——梁带NCBI,ENSEMBL,UCSC，还有一些也可以了解一些（uniprot,IMGT,KEGG，OMIN，TIGR，GO）同样也是百度文库自己搜索资料，但是这次需要自己去官网一个个页面点击看，一个个翻译成中文理解吃透；数据格式讲起了就多了，这个主要是在项目流程中慢慢学，或者你有机会去上课，不然你看来也是立马忘记的。橡郑芦
2. 答：这类研究一般是分析自己或者合作者实验室里未发表的数据，并试图获得新的生物学发现。相比与0级，这已经有很团绝茄大的进步，并且是训练生物信息学者最好的途径之一。塌察可以练习将已有的生物信息学技术来做出真正生物学发现的技巧，学习更多的生信技术和生物学知识，可以启发、衍生出2级和3级的好课题。评价1级科研的功底和水平要看数据有多复杂, 是否需要生信人员写一些程序和算法（而不是只用他人的工具），生信分析在整个研究中的有重要性 (最重要的假设发现是不是由生物信息分析出来的，文章中生信图表的个数)，实验与计算的结合程度 （实验与计算 环环相扣，而不是高通量实验数据获得完跟个生信分析就拉倒），以及研究中生物学的发现是不是真的有意思，等等宏拿。因此兄弟我的看法是，1级虽然是“入门级”，但非常非常重要，所有生信专业研究生的必经之路，非生信领域的学者或学生，能达到1级中已可算是高手，进阶到1级上那就是凤毛麟角了。

问：生物信息在国内前景究竟如何？

1. 答：实际上生信的壁垒在于计算机水平，一个有cs基础的人转行生信的难度，明显低于一个纯生命科学专业转行生信。故如果转行cs再回到生信需要的缓冲期很短，而生信再转行深度学习，需要的缓冲长一些，但是因人而异，因为已经有python和基本的数据库，相比纯生物学优势很大。如果想要在生信上进一步做科研，目前来看前景（短期）还是很积极的，无论是施一公领衔的结构生物学（更重要的是设备，但也有分析），还是华大领衔的基因组学，以及目前非常火热的精迟纤准医疗都与生信有密切联系。随着深度学习的发展，以各类数据库为基础的智能诊断也与生信有关。从另一个侧面看，生物专业未来的需求应该是多面的，未来做生物学研孙斗究（或者说基础医学研究），需要计算机、数学等等方面的人才会很多（例如计量生物学）。很多实验（基本的养细胞，跑胶）可能在未来的效率会大幅提升，纯实验所需人手可能在饱和，照目前美国技术迭代的速度，几乎所有科技行业每半年都需要进修与学习，相对于生命科学来说，有生信基础的人会面临小一些的压力。（但是只是相对大部分生命科学学生）必须承认金融与cs未来还会是最具吸引力的行业，但是如果可以在生信则旦磨上做好，那么掌握医学统计学；统计学，python和组学知识的人才无须担心前景，但是读PhD期间，可能很多人会因为枯燥的湿实验，大量重复性的工作而失去耐心，故仍旧要考虑自己的情况。
2. 答：现在生物信息学相关的工作机会是越来越多了。在科研方银培面，由于测序技术的普及，越来越多的实验室进行了测序分析，相应的需要更多的生物信息学的人来分析这些数据，所以现在传统的生物公司在招生物信息分析人员，还有更多的创业型小公司专门缓做做各种单纯的生物信息分析，另外就是各个高校院所包括有科研实力的医院，都需要相应的生物信息学人才。当然，这个只是从一个方面说明现在生物信息学（主要是基因组学相关）就业机会增多扰搏衡，但是目前的工资待遇问题，生物信息学主要还是跟着生物学的走，而不是跟着CS的走，所以能转CS而继续做bioinf的，绝对是真爱啊！
3. 答：应弯御桐该是生物类里面就业最好的了，虽然也是不怎么能看，不过其他生物类更是不行，完全渣。
   本行就是做生物信息的工作，分析基因埋坦组，疾病之类，把数据和生物联系起来，虽然现在还没发展好，不过几年以后应该还是有一定前景的。编程能力好的也可以做程序员去IT或者通信，不过生信不太强调编程能力，主要是生物概念和软件，所以要自学一些。，大部分和生物信息的关系已经不是很大了。现在有的小的基因检测公司虽然招聘职位上写的生物信息工程师，但实际上干的是程序员的活，比如搞数据库，搭网站，写前端出报告。传统的搞科研服务的公司。工资高拆核的一般是产品和销售。在有的公司里，当个主管工资都很低。
4. 答：前景还算可以
   我说一些具体的吧丛陪，我感觉现在主要对生物信息工程师的威胁就是各种生物云平台，如果真的都可以做成傻瓜化，可视化，咱们做生信的真的要失业了……
   不过值得庆幸的是，他们做的并不怎么样，我们还可以活，毕竟可视化的东西只能适用于标准的流程。
   在国外各种生物云的目标主要是合规性，但是在国内大家竞争比渗敬蠢较激烈，各种花样的云平台酝酿而出。
   对于生物云我们选择最合规的稿唯就好。
   如果说咱们自己做私有的计算平台，我觉得可以找第三方帮助搭建，国外可以找BIOTEAME，国内可以找ind，因为大家没必要把精力当在平台搭建上，他们反而更有经验。
   我们要做的是流程优化，等等

问：利用EST和生物信息学及细胞分子生物学技术研究某基因的功能，试设计技术路线

1. 答：首先，EST序列的测序，得到该基因的EST片段
   其次，，用Go或者KEGG，分析该基因的功能分类，所在代谢途径等；通过NCBI Blastn，BlastX，tBlastn等比对与该基因同源性较高的基因序列和可能功能；通过ExPASY研究蛋白的特点，二级结构，三级结构等。
   之后，根据已得到的信息，依据可能的功能设计细胞实验，
   例如，1利用已知序列，通过RACE方法获得该基因的cDNA全序列，通过或者Tail PCR的方法获得全基因组序列及promotor序列
   2构建过表达载体，在生物体内过表达该基因，看是否获得可见表性
   3构建反义RNA载体，或棚拍者RNAi载体，使该基因的表达沉默，看是否获得可见表性
   4通过的方法，敲除该基因，看是否获得链昌羡可见表性
   5在该基因缺失的突变生物体中，过表达该基因，看表性能够得到互补t突变
   6在该基因启动子后接上报告基因，观察该基因的表达位置
   7在将该基因与报告基因后，进行亚细胞定位
   8采用real-time-PCR的方法，观察该基因的表达模式
   9采用的方法，观察与该基因有关的基因
   10采用的方法，寻找与该基因相互作用迅缺的蛋白。
   等等等等
2. 答：先利用EST在网上找出你要研究的那个物种的DN***段，看看在别的物种中磨仿它具有啥功能，根据保守性在薯卜你所研究的物种中应该也差不多。瞎手纤把你的基因正义和反义片段分别导入你所研究的物种中，看看对它用啥影响就行啦。你要是没有这个基因的全长那就麻烦了。